Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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