Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms