Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMAGPQ0VAQ4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMAGPQ0VAQ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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