Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms