Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms