Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.7 ms