Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms