Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms