Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms