Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms