Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms