Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms