Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms