Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms