Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms