Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD1P98174 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD1P98174 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms