Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD3P84022 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms