Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAE1P78406 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAE1P78406 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms