Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TPTEP56180 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms