Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3M2P53677 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3M2P53677 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms