Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP98P52948 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP98P52948 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms