Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB28P51157 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB28P51157 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB28P51157 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB28P51157 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB28P51157 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB28P51157 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms