Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms