Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms