Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX1P48742 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX1P48742 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX1P48742 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX1P48742 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms