Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms