Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME1P48163 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME1P48163 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME1P48163 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ME1P48163 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms