Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms