Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCAMP43121 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCAMP43121 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms