Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms