Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms