Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms