Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPARGP37231 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms