Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms