Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2IP36954 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms