Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms