Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms