Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF2P35240 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF2P35240 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF2P35240 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms