Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms