Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM5P33992 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCM5P33992 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCM5P33992 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM5P33992 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM5P33992 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM5P33992 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms