Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXD3P31249 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD3P31249 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD3P31249 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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