Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD34P28906 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD34P28906 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms