Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms