Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms