Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFYAP23511 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFYAP23511 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFYAP23511 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFYAP23511 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms