Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREB1P16220 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREB1P16220 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREB1P16220 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms