Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms