Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms