Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A1P11836 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms