Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI3P10071 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms